После второй палатализации стало возможным противопоставление *ě и *a после палатальных, а значит *ě к этому времени уже не мог быть открытым монофтонгом, ну или перестал действовать внутрислоговой сингармонизм, что маловероятно. Также позже в результате удлинения кратких возник новый *ē, который не совпал с *ě. Все это наводит меня на мысль, что *ě довольно рано дифтонгизировался, а затем в ряде диалектов сузился.